Kedai Tasogare, komik ini menceritakan tentang anak SMU yang bernama Mikoshiba Kaname. Mikoshiba adalah anak yang terkenal di sekolahnya karena dia sangat tampan. Sampai-sampai sahabatnya sering menjual fotonya pada fans-fansnya di dalam dan di luar sekolah! Hal yang di sayangkan dari Mikoshiba adalah wajahnya yang kaku dan dahinya berkerut, sehingga dia sering di panggil "Si Muka Badak!"
Selain tampan dan tidak ramah. Mikoshiba memiliki kemampuan spesial, dia bisa bicara dengan tumbuhan. Selain itu, dia juga bisa melihat makhluk-makhluk yang tidak bisa dilihat orang biasa. dan suatu hari dia menemukan sebuah gang misterius yang tidak semua orang bisa melihatnya.Danhal aneh lainnya dari gang tersebut adalah, tidak ada matahari pagi, yang ada hanya matahari senja dan malam hari.
Di dalam gang misterius itu terdapat banyak kedai, dan satu diantaranya adalah Kedai Tasogare. Mikoshibapun bekerja part-time di kedai tersebut dan menjadi seorang manajer. Dan tanpa dia ketahui, ibunya adalah mantan manajer kedai tersebut.
Dan ternyata, setiap kedai di gang tersebut mempunyai sebuah pekarangan. Dan sebagai manajer dari Kedai Tasogare, Mikoshiba mempunyai tugas untuk membuat pohon besar di pekarangan Kedai Tasogare tumbuh subur dan berbuah.